sdsl comparison #25
sdsl comparison #25
Conversation
| For comparison with range min-max tree implementation from [sdsl-lite](https://github.com/simongog/sdsl-lite) (Release build required: `cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release`): | ||
|
|
||
| ```bash | ||
| sudo cpupower frequency-set --governor performance |
There was a problem hiding this comment.
This is a very limited instruction for performance stabilization, cpupower is not shipped by default in ubuntu as af as I know. I you really want the make a hint for a reader about performance variance, refer to the original page at google benchmarks.
| ``` | ||
|
|
||
| For visualization, write the JSON output to a file using `--benchmark_out=<file>` (e.g. `./bench_rmm --benchmark_out=rmm_bench.json`) and plot it with `misc/plot_rmm.py`. | ||
| For comparison with range min-max tree implementation from [sdsl-lite](https://github.com/simongog/sdsl-lite) (Release build required: `cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release`): |
There was a problem hiding this comment.
Although rookies still make mistakes about measuring performance in debug build, the remark in the brackets is common knowledge. If you want to make a hint for novices, it is better to leave a message "make sure to build with -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release to achieve intended performance`" to actually pinpoint what is it intended for.
| /usr/local | ||
| ) | ||
|
|
||
| if(NOT SDSL_INCLUDE_DIR) |
There was a problem hiding this comment.
Note that SDSL is intended for comparison only and thus it is better to configure it to be easily excluded, i.e. for example introducing some variable like THIRD_PARTY_BENCHMARK and set to false by default, activating only when it is intended.
|
|
||
| ## 1. Введение | ||
|
|
||
| В рамках семестрового проекта была реализована структура данных **Range Min–Max Tree (RmMTree)** над битовым вектором для операций над **правильными скобочными последовательностями (balanced parentheses, BP)**. Реализация основана на идеях из статьи (ScienceDirect): https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304397516300706 |
There was a problem hiding this comment.
Общепринятые стили цитирование либо сразу писать как-то так
Cordova J., Navarro G. Simple and efficient fully-functional succinct trees //Theoretical Computer Science. – 2016. – Т. 656. – С. 135-145.
Или использовать менеджер ссылок типа bibtex, quarto умеет импортировать его, но я не проверял работает ли в режиме презентации. Стиль ссылок тоже можно настроить, в презентации это обычно краткая ссылка типа авторы+год+гиперссылка.
Ссылаться на ScienceDirect -- это примерно тоже самое, что ссылаться на MIT Press при цитировании "Алгоритмы Построение и Анализ" КЛРШ
|
|
||
| Цель проекта — получить | ||
| - **сжатую** ($o(n)$ доп. памяти) | ||
| - и **быструю** (все операции выполняются за $O(\log n)$ времени и используют различные оптимизации, существенно уменьшающие константы) |
There was a problem hiding this comment.
Можно оставить так, но отмечу, что я никогда не ставил задачи сделать "асимптотически быстрое" решение, я ставил задачу сделать "просто быстрое" решение на размерах в диапазоне хотя бы до 2^32
| - **сжатую** ($o(n)$ доп. памяти) | ||
| - и **быструю** (все операции выполняются за $O(\log n)$ времени и используют различные оптимизации, существенно уменьшающие константы) | ||
| - структуру, поддерживающую типовой набор запросов: | ||
| - `rank` / `select` по битам, |
There was a problem hiding this comment.
Что такое rank/select? Я то знаю, откуда это знает зритель?
| - и **быструю** (все операции выполняются за $O(\log n)$ времени и используют различные оптимизации, существенно уменьшающие константы) | ||
| - структуру, поддерживающую типовой набор запросов: | ||
| - `rank` / `select` по битам, | ||
| - операции с **excess** (префиксная сумма с шагами +1/−1), |
There was a problem hiding this comment.
Плохо написано, лучше excess(i)=rank_1(i)-rank_0(i)
| - `select`: `O(n)`, | ||
| - `range_min/max` и `mincount/minselect`: `O(j-i)` и т.п. | ||
|
|
||
| Плюсы: |
There was a problem hiding this comment.
Как-будто плюсы и минусы не информативны
| - структуру, поддерживающую типовой набор запросов: | ||
| - `rank` / `select` по битам, | ||
| - операции с **excess** (префиксная сумма с шагами +1/−1), | ||
| - `fwdsearch` / `bwdsearch`, |
There was a problem hiding this comment.
Опять же, что за операции непонятно. Если ты собираешься всё это словами проговаривать, то скорее всего дальше уже просто никто слушать не будет.
Наиболее разумный вариант -- написать, что основное назначение реализация навигации по правильной скобочной последовательности, т.е. расписать что такое enclose желательно с картинкой, а вспомогательные операции просто перечислить
| ## 2. Постановка задачи и требования | ||
|
|
||
| ### 2.1. Входные данные | ||
| - Битовая строка `'0'/'1'` или массив 64-битных слов `uint64_t` с укладкой **LSB-first** (младшие биты — более ранние позиции). |
There was a problem hiding this comment.
Способ представления битовой строки не относится к твоей работе, детали о uint64_t и lsb-first излишние.
| - `select` в блоке делается через перебор установленных битов (внутри 64 бит), | ||
| - удобно читать байты/16-битные фрагменты для LUT и SIMD. | ||
|
|
||
| #### 3.2.2. Идея блокирования и дерева |
| ### 4.2. SIMD (AVX2) для поиска по префиксу в листе | ||
|
|
||
| В реализации предусмотрена опциональная поддержка AVX2 (`PIXIE_AVX2_SUPPORT`): | ||
| - берутся 16 бит (`get_u16`), |
There was a problem hiding this comment.
Лично я ничего не понял из последующего описания
| - для `minselect` — заранее генерируется `q` в допустимом диапазоне (через `mincount`). | ||
|
|
||
| ### 7.2. Поддерживаемые параметры бенчмарков (как аргументы командной строки) | ||
| - `--min_exp`, `--max_exp` — диапазон размеров `N = 2^e`, |
There was a problem hiding this comment.
Зачем вся эта информация? Лучше добавь конкретные картинки
Uh oh!
There was an error while loading. Please reload this page.